В 2001 году начался очередной этап реставрации Покровского собора. Ремонтно- восстановительные работы сопровождаются целым комплексом научных исследований памятника и прилегающей территории. В начале 2010 года был определен двухгодичный план реставрационных работ к юбилею памятника.

В 2010 году сотрудники «Спецпроектреставрации», МНРХУ, ООО «Альтернативные технологии строительства» выполнили большой объем работ:

• Восстановлены росписи сводов северного крыльца собора. Во время реставрации 1950-х гг. своды, ввиду плохого состояния росписи, были покрыты слоями обмазки и окрашены в цвет, который имитировал старую штукатурку. Реставраторы обнаружили остатки самого раннего слоя темперной росписи, вероятно, начала XVIII в.

  

  Путем кропотливых расчисток и докомпоновок удалось воссоздать композицию, не имеющую аналогов в сохранившейся к настоящему времени стенописи собора: на небесно-голубом фоне разбросаны золотые розетки, состоящие из кругов и овалов. В качестве единственной аналогии декоративного решения пространства можно рассматривать украшение розетками из полихромных изразцов наружных граней шатра центральной Покровской церкви.

• Начата реставрация перекрытия западной внутренней галереи. Этот сложный участок оставался закрытым от посетителей строительными лесами в течение длительного времени. Плоское перекрытие галереи уникально не только для собора, но и для древнерусской строительной практики в целом. В отличие от остальных арочных сводов галереи, этот участок перекрытия практически плоский и выложен из маломерного кирпича кессонами, обрамленными выступающими кирпичами большего размера. Как и стены западной галереи, перекрытие расписано «под кирпич».

• Отреставрирован кирпичный пол центральной церкви Покрова Богородицы. Последняя реставрация пола осуществлялась в 1960-е гг. За истекшее время кирпич на многих участках истерся и осел. Реставраторы максимально сохранили участки старой кладки и полностью восстановили поврежденные участки.

  

  Большое внимание уделялось точному соблюдению рисунка пола, который был выложен в «шашку» из маломерного кирпича, поставленного на ребро.

• Начата работа по восстановлению росписей внутренней галереи и площадок собора. За долгие годы активного посещения собора сильно пострадали участки галереи с темперной росписью конца XVII в.

  

  На стенах наблюдались сколы, трещины, потертости и общее загрязнение. Выработав методику восстановления росписи, реставраторы поновили стены северо-западной площадки внутренней галереи.

• Восстановлены росписи в куполе церкви Василия Блаженного. Из-за неудовлетворительного состояния окон барабана масляная живопись начала XX века в последние годы сильно пострадала. В 2010 г. произведена замена окон и полностью восстановлена живопись в барабане.

  

• Комплексные ремонтно-восстановительные работы проведены на обеих ярусах колокольни. Длительное время в этих помещениях осуществлялся лишь косметический ремонт. Был укреплен фундамент колокольни, заделаны трещины в кирпичных стенах, осуществлена побелка стен, установлены новые оконные заполнения и двери.

1. продолжение реставрации росписей внутренней обходной галереи и площадок;
2. реставрация фасадной иконы «Богоматерь Знамение» первой трети XVIII в. на восточном фасаде собора;
3. реставрация интерьеров церквей Варлаама Хутынского и Григория Армянского;
4. восстановление росписи свода южного крыльца собора;
5. реставрация трех уникальных вкладных в собор металлических хоругвей начала XX в.;
6. реставрация большемерной иконы XVIII в. «Спас Нерукотворный с предстоящими Максимом Блаженным и Максимом Исповедником».